Scanpy: Single-Cell Analyse

Standaard single-cell RNA-seq analysepijplijn. Gebruik voor QC, normalisatie, dimensionaliteitsreductie (PCA/UMAP/t-SNE), clustering, differentiële expressie en visualisatie. Het best voor verkennende scRNA-seq-analyse met gevestigde workflows. Voor deep learning-modellen gebruik scvi-tools; voor gegevensformaat q

Bron: github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/scanpy · Licentie: MIT