Arboretum

Afleiden van genregulatoire netwerken (GRN's) uit genexpressiegegevens met behulp van schaalbare algoritmen (GRNBoost2, GENIE3). Gebruik bij analyse van transcriptomicsgegevens (bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq) om transcriptiefactor-targetgenrelaties en regelgevingsinteracties te identificeren. Ondersteunt gedistribueerde berekeningen.

Bron: github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/scientific-skills/arboreto · Licentie: MIT